Baltian maissa partisaani-termiä ei käytetä aseellisista vastarintataisteluista, koska sanalla oli neuvostoaikana politisoitunut merkitys. Virossa metsavennad, latviaksi mežabrāļi ja liettuassa miško broliai olivat Virossa, Latviassa ja Liettuassa toisen maailmansodan aikana ja myöhemmin Neuvostoliiton hyökkäyksen jälkeen toimivia yksiköitä, jotka jatkoivat taistelua neuvostovaltaa vastaan.

Vuonna 1940 Neuvostoliitto miehitti ja liitti Viron, Latvian ja Liettuan. Sorron uhan vuoksi metsiin piilotettiin entisiä valtionhenkilöitä, sotilaita ja muita yhteiskunnallisesti aktiivisia tai huomattavia henkilöitä. Erityisesti metsäveljien määrä lisääntyi 14.6.1941 tapahtuneen joukkokarkotuksen jälkeen.

Saksan miehityksen aikana metsäveljet muodostivat Itsepuolustusjoukot.

Puna-armeija valloitti Viron, Latvian ja Liettuan vuosina 1944–1945. Seuraavina vuosina yli 70 000 Baltian kansalaista piiloutui metsiin stalinististen sortotoimien ja neuvostovallan vuoksi. Vastarintayksiköiden koko ja kokoonpano vaihtelivat yksinomaan itsepuolustukseen aseistautuneista metsäveljistä suuriin ja hyvin organisoituihin taisteluvalmiisiin ryhmiin.

1940-luvun lopulla ja 1950-luvun alussa Britannian (MI6), Amerikan ja Ruotsin tiedustelupalvelut toimittivat Metsäveljille laitteita, viestintää ja logistista tietoa. Tällaisella avustuksella oli keskeinen rooli Baltian vastarintaliikkeen ohjauksessa, vaikka se väheni merkittävästi vakavan kompromissin jälkeen MI6:n Operation Jungle -operaatiossa, kun brittiläiset kaksoisvakoilijat (Kim Philby ja muut) välittivät tietoja Neuvostoliiton viranomaisille, jolloin KGB pystyi tunnistamaan, soluttautumaan ja hajottamaan monet Baltian partisaaniyksiköt, ja leikkaukset estivät niitä altistumasta länsimaiselle tiedustelulle.